肠易激综合征的治疗，包括一般治疗、对症治疗以及心理、行为疗法，具体如下：
第一、一般治疗往往是了解导致肠易激综合征的触发因素，并尽量消除。指导病人建立良好的生活习惯和饮食结构，避免诱发食物，并且告诉患者肠易激综合征本身就是一个功能性的疾病，解决患者的顾虑，对于失眠焦虑者也可以给予镇静药。
第二、对症治疗，对于腹痛的患者可以给予解痉药，常用的是匹维溴铵，可以缓解平滑肌的痉挛，还可以降低内脏的高敏状态，对腹痛有一定的疗效。对于腹泻的患者可以适当选用止泻剂，轻症者可以选用蒙脱石散，重度患者可以选用盐酸洛哌丁胺等。但是，盐酸洛哌丁胺这类止泻药虽然效果好，但是不宜长期使用。便秘的患者可以给轻泻剂，比如聚乙二醇或乳果糖等，也可以用促动力药，如枸橼酸莫沙必利或者盐酸伊托必利等。焦虑、失眠的患者可以予抗焦虑药，同时肠道微生态制剂比如双歧杆菌乳酸杆菌等也有一定的疗效。对于症状顽固、严重，一般的治疗和药物都无效的患者，可以给予心理行为的治疗，包括心理治疗、认知疗法，甚至催眠疗法。