双氧水漱口的好处有，过氧化氢溶液是一种氧化剂，对厌氧菌有良好的抑制作用，牙齿间隙经常滞留食物残渣时可有效分解龈下及隐蔽部位的细菌，减少细菌感染的机会。
过氧化氢可与组织液中的过氧化氢酶接触，释放出新生态的氧，产生大量气泡，起灭菌、止血、除臭等作用，可以改变牙周袋内的厌氧环境，避免牙龈红肿，特别是发生急性坏死性溃疡性龈炎时过氧化氢溶液能起到良好的抑菌效果。