抗精子抗体是复杂的病理产物，男女都可以产生，其确切的原因并没有完全明了。一般是由于男性的精子和精浆，由于各种原因接触到血液系统，被身体自身或者被女性的身体识别为特异性抗原，而产生相应的抗体，引发的免疫反应。其结果是阻碍精子与卵子结合，而容易导致不育，甚至会导致胚胎死亡和流产。
容易产生抗精子抗体的男性，通常是有精子的自发凝集，睾丸外伤、手术、活检史，有输精管的阻塞，或者输精管吻合手术史，有输精管结扎史，或者有生殖道感染史。对于女性来讲，常有生殖道的感染，比如子宫内膜炎、阴道炎、输卵管炎等生殖系统的炎症，或者月经期间出现性生活。出现抗精子抗体，对精子有制动和细胞毒的作用，因此对怀孕会有很大的影响。