临床上常用的抗结核药物有时会导致副作用，比较常见的有肝功能损伤以及高尿酸血症等。治疗肺结核药物通常分为一线抗结核药物和二线抗结核药物两大类，对于初治患者通常选用一线抗结核药物，包括异烟肼、利福平、吡嗪酰胺和乙胺丁醇，这些药物杀菌效果好，不良反应小，均可口服给药，自行在家服用即可。
异烟肼常用治疗剂量不良反应发生率比较低，主要包括周围神经炎、中枢神经系统中毒症状和肝脏损害等。利福平主要不良反应是胃肠道不适、肝功能损害和药物热，吡嗪酰胺不良反应主要是药物性肝炎、高尿酸血症以及皮疹和胃肠道反应，乙胺丁醇常见不良反应是球后视神经炎、过敏反应、药物性皮疹、皮肤黏膜损伤等。另外，吡嗪酰胺服用后可使皮肤出现过敏反应，如果不注意防晒会导致皮肤发黑，利福平服用后可能会导致患者泪液、尿液、汗液以及粪便呈现橘红色。