治疗睡眠障碍的药物有很多，一个就是安眠药，现在常用的安眠药有苯二氮卓类的安眠药和非苯二氮卓类的安眠药，还有一些褪黑素受体激动剂。
苯二氮卓类的安眠药里头有地西泮、劳拉西泮、氯硝西泮、奥沙西泮、马来酸咪达唑仑、艾司唑仑、阿普唑仑等等，非苯二氮卓类安眠药有酒石酸唑吡坦、扎来普隆、佐匹克隆、右佐匹克隆等等，褪黑素受体激动剂可以有阿美拉丁等等。
另外带有一些镇静安眠的抗抑郁药，也有一定的改善睡眠的作用，比如阿米替林、米氮平，乃至曲唑酮等等。另外，如果睡眠障碍是焦虑、抑郁引起来的，最根本的应该抗焦虑、抑郁治疗，应该使用5-羟色胺再摄取抑制剂，或者5-羟色胺和去甲肾的双通道再摄取抑制剂来进行治疗。