补牙杀神经有一定害处，如下：
一、磨开髓腔、根管预备等操作，切割了较多牙体组织，破坏了牙齿的抗力性，使牙齿可能发生冠折、根折等。
二、摘除牙髓组织后，牙齿失去了营养供给，牙质酥脆、干燥，承受较大咬合力时，容易发生劈裂或崩折。
三、随着时间的延长，牙齿逐渐失去光泽，颜色变得暗黑，与相邻牙齿存在明显差异，影响美观。
四，根管治疗后的牙齿，对冷、热、酸、甜等刺激不产生反应，降低了咀嚼效率，不利于食物的消化和吸收。
五、根管治疗后的牙齿，容易与牙周组织产生粘连，在拔牙时发生断裂，给拔牙增加了较大的难度。