扁桃体青春期后开始萎缩，具体时间需要根据每个人的体质以及健康状况等具体因素，进一步加以分析。
扁桃体也就是腭扁桃体，它是咽腔淋巴组织中的最大的一组，位于左右前后咽弓之间的扁桃体窝内。扁桃体对人体具有一定的免疫功能，当出生的时候扁桃体没有生发中心。随着儿童逐渐生长发育，接触的变应原逐渐增多，使扁桃体逐渐的增大，3-5岁的时候开始增大。6-7岁扁桃体会增大的比较明显，这个时期属于生理性肥大。到了青春期以后，由于扁桃体的免疫功能逐渐的下降，这时候扁桃体就会逐渐的缩小。
对于扁桃体开始萎缩的青少年，饮食上应以清淡、易消化、富含营养的食物为主，另外应注意早晚用淡盐水漱口，保证口腔的清洁卫生，避免扁桃体感染发炎。