预防囊肿要避免盆腔的感染，卵巢囊肿相关的高危因素有年龄，多发生在育龄的女性，由于激素水平的变化，比如服用了药物促排卵，伴有既往卵巢囊肿的病史，有子宫内膜异位症的病史，容易引起子宫内膜异位囊肿、囊腺瘤或者皮样囊肿，这都是病理性囊肿。
生理性的囊肿，比如滤泡囊肿或者黄体囊肿，一般是在月经周期中随着正常的卵巢持续增长而形成功能性囊肿，这种功能性囊肿对身体没有危害，也不会引起疼痛和不适，一般在2-3个月经周期后就自行消失，可以通过定期的超声复查、随访，而病理性囊肿就需要进行手术治疗。