肩胛骨疼，常常是由肩胛骨背侧的肌肉筋膜炎症导致的，与长时间肩胛背侧肌肉活动量过少有一定关系，可以在肩胛骨背侧的肌肉处，按压有痛点，在痛点部分可以进行局部的外敷，应用抗炎止痛膏药，可以同时口服抗炎止痛药。
有时疼痛的位置发生在肩胛骨的内侧缘，与脊柱之间的位置，这位置是斜方肌和大小菱形肌疲劳、肌肉劳损、痉挛导致的疼痛，应该多进行耸肩活动，也可以进行肩关节前伸、后缩等活动，通过上述活动锻炼斜方肌和大小菱形肌来改善肌肉的局部血液供氧，缓解肌肉的痉挛，疼痛可以逐渐的缓解。
少数情况下，肩胛骨的疼痛还伴有局部的麻木，有时会伴有上臂外侧的感觉麻木，甚至严重时会有疼醒的问题，这也可能是由于颈部的神经压迫，导致局部的肌肉失神经支配引起的，应该做肌电图检查才能够确诊。