磁共振血管造影一般不会有什么风险，因为磁共振提供的电子场对人体无害、无痛。但是有些特殊人群不适宜进行磁共振检查，是由于体内装有金属物品和体重过重。
所以，对于体重超过150kg的人不适合做磁共振，而且体内如果安装有心脏起搏器或其他的金属制品，如人工关节、人工瓣膜、螺钉或者金属夹等，都不适合在磁共振血管造影，以免金属物体在磁共振下发热或损坏。
同时，需要持续生命支持的装置，如氧气，也不适于在磁共振造影过程中使用。
而妊娠、极度焦虑和激动的病人，也不适合进行磁共振血管造影。
因为时间较长，可能会造成病人情绪失控等风险。另外，在检查之前4-6个小时不要进食。