生殖器上有水疱，考虑是生殖器疱疹的可能性。需要及时到医院进行相关检查来明确诊断，做单纯疱疹病毒监测，如果确诊为是生殖器疱疹，建议服用更昔洛韦，局部通过阿昔洛韦软膏，或者是干扰素软膏来进行治疗。在治疗期间，要注意清淡饮食，不要喝酒，不要吃辛辣、刺激、生冷性的食物，适当的去锻炼身体，提高机体免疫力，有助于防止生殖器疱疹的复发。治疗期间，不要发生性关系，防止出现男女之间的性交叉感染。