金霉素眼药膏的使用方法通常是嘱患者眼球向上翻转，然后用手指扒开患者的下眼睑，把金霉素眼膏涂在患者的下眼睑穹窿部，嘱咐患者闭上眼睛，同时转动眼球，金霉素眼膏就能够在眼睛表面均匀分布了，这是金霉素眼膏的使用方法。
金霉素眼膏是抗生素眼膏，在临床上主要用于抗感染的治疗。使用方法通常是夜间涂用，因为药膏跟药水相比穿透力减弱了，没有药水的穿透性好，但是在眼睛的停留时间会延长，所以比较适合患者在夜间给药。而且金霉素是油膏，使用之后会影响视力，使用油膏之后眼睑表面会有油腻的感觉，会引起视物模糊，所以也是金霉素适合夜间使用的原因。
但是，因为金霉素是油膏，能够很好地保护眼球的表面，所以在临床上还常常用于眼睑闭合不全可能会引起暴露性角膜炎的患者进行预防，或者在手术中要进行全麻的患者，也会给患者涂上金霉素眼膏，避免患者因为眼睑闭合不全导致角膜发生损伤。除此之外，在眼科的手术中，如果是做的眼睑皮肤的手术切口，也可以术后给予金霉素眼膏在患处进行涂抹，可以达到局部的皮肤润滑的作用，而且还可以防止术后换药的时候发生敷料和皮肤的粘连。