排尿后尿道口的刺痛，通常是跟泌尿系统的疾病相关，如泌尿系统的炎症，泌尿系统的炎症包括泌尿系统下尿路如尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等部位的炎症以及上尿路的肾盂肾炎。这些感染可以造成尿路的刺激症状，如尿痛，伴有尿频、尿急，严重者可以出现血尿、发热、寒战等全身症状。
其它泌尿系统疾病，如泌尿系统结核、泌尿系统肿瘤、泌尿系统结石、泌尿系统损伤、泌尿系统异物或下尿路梗阻，均可以导致泌尿系统的感染症状出现，伴有尿痛。因此，临床上应明确相应的疾病，针对性的治疗。