甲状腺炎会引起甲减的，尤其是桥本氏甲状腺炎，即慢性淋巴细胞性甲状腺炎，也是自身免疫所引起的甲状腺疾病，早期产生针对甲状腺的自身抗体。甲状腺球蛋白抗体、甲状腺微粒体抗体多是在查体偶然发现，患者并没有出现临床症状，此病的特点是淋巴细胞逐渐代替甲状腺细胞，最后导致甲状腺功能减退症。
从抗体出现阳性到发生甲状腺功能减退症因人而已，时间长短不一。有些患者3-5年出现甲减，有些患者10年、20年都没有发生甲减。在没有发生甲减以前是不需要治疗的，当发生甲状腺功能减退症时甲状腺激素、检验血、查甲状腺激素水平不同程度的下降，而促甲状腺激素水平升高，需要给予左甲状腺激素替代治疗，大多数患者都是需要终身治疗的。