自闭症的康复治疗方法大概有ESDM教学、ABA训练、TEACCH干预，以及补充维生素D、高压氧治疗。如果有精神病症状，可以使用小剂量的抗精神病药，如果有多动注意缺陷，可以使用多动症的药物来进行干预。治疗的原理是促进人际关系的发展，以及技巧的发展。
自闭症的患者存在“心理理论”缺陷，以共同注意缺陷，对他人心理活动缺乏推测能力，有共同注意缺陷，患者不能像正常的儿童，共同注意某事物的能力，因此患者社会参照能力差，不能与他人分享情感、感觉和经验。技巧的发展，促进患者注意力的发展，增加对环境的兴趣和亲密感，增加双向和有目的的沟通，帮助其表达使用感受，促进逻辑思维发展的能力。有研究认为，自闭症患者外周血液维生素D水平较低，通过补充维生素D而起到治疗的作用。高压氧治疗是通过抗氧化以及抗炎症等机制，而起到治疗自闭症的作用。