如果输尿管结石合并有炎症，所服用的药物主要包括两大类：
第一大类，抗生素，需要根据药敏试验选择敏感的抗生素进行处理，常用的抗生素有头孢菌素，喹诺酮类消炎药，如左氧氟沙星、莫西沙星等等。
第二大类，针对输尿管结石所采用的药物，主要包括解痉、止痛药物，促进结石排出的药物，解痉止痛药物主要包括布洛芬、双氯芬酸钠等；促进结石排出的药物主要有净石灵胶囊、肾石通颗粒、盐酸坦洛新等。经过系统正规的检查及治疗，输尿管结石和炎症均可以好转治愈。