灰指甲早期症状感染比较轻微，被感染的指甲数也比较少，建议选择外用药物进行治疗。先用热水泡脚20-30分钟，将病变的灰指甲泡软，再使用指甲剪将灰指甲尽可能将多的剪掉，然后使用阿莫罗芬搽剂进行涂抹，涂抹后使用保鲜膜包裹。
使药物得到充分的吸收，每周涂抹2次，直到新指甲完全长出。如果灰指甲早期伴有明显脚气的患者，建议口服抗真菌的药物进行治疗，常用的抗真菌药物有伊曲康唑胶囊、特比萘芬片等。
伊曲康唑胶囊服用7天，停药3周，再服用7天，特比萘芬片需要连续服用2-4周，用药时间的长短主要与灰指甲的程度有关。