口腔如果得了真菌感染，可以先用小苏打水漱口，也可以局部或者全身应用抗真菌的药物。口腔最容易得的真菌感染是白色念珠菌感染，婴儿称为鹅口疮。
一般建议使用小苏打水进行漱口，也就是用2%-4%的碳酸氢钠溶液进行漱口，或者用其涂擦婴儿口腔黏膜。这样可以使口腔内的环境呈碱性，抑制白色念珠菌的生长和繁殖。如果比较轻的鹅口疮，在2-3天就可以被控制。如果是成年人，除了用小苏打水漱口，也可以用抗真菌的药物局部外用，例如可以用制霉菌素或者是酮康唑的软膏外用在白色念珠菌感染的病损上，也可以全身应用抗真菌药物，例如全身可以应用制霉菌素片、酮康唑片、咪康唑片。