因为婴儿的消化功能还不健全，稍有不适当的因素刺激就可以引起消化功能紊乱，比如孩子受凉以后尤其腹部受凉以后，就可以出现拉屎酸臭。孩子消化不良也可以导致孩子拉屎酸臭，比如孩子吃的东西过多，尤其是吃了蛋白质过多的食物，比如肉、鱼，这些东西吃的太多就会引起消化不好，大便可以出现酸臭的情况。针对这些情况可以给孩子吃消食的药物，另外可以给孩子吃益肠道的益生菌，比如妈咪爱或者乳酸杆菌帮助宝宝的消化功能恢复。
如果孩子拉屎酸臭也有可能是肠炎引起的，小儿患有肠炎也可以导致大便次数增多、味道酸臭。这时候要给宝宝的大便做化验，明确一下是否有肠炎造成的宝宝大便酸臭，在医生的指导下对因治疗更好一些。