治疗血尿必须找到引起血尿的原因，对原发病进行治疗才可以缓解。血尿要注意是否有泌尿道肿瘤的可能性，做肾脏、输尿管B超可以发现，如果是肿瘤，必须将肿瘤切除血尿才可以缓解。血尿也可能是结石引起，小的结石应该多喝水，多排尿，促进结石排出。
大的结石需要通过体外震波碎石、输尿管镜或者经皮肾镜手术将结石击碎，排出体外。最常见的血尿就是泌尿道感染导致，多喝水，吃消炎药，绝大多数可以达到治愈。泌尿道结核也会导致血尿，必须抗结核治疗，加强支持治疗才可以缓解。
肾下垂导致的血尿必须多卧床休息，运动性血尿必须减少运动量，防止血尿加重。