医用石蜡油的主要作用是润滑，临床的应用范围非常广泛，如果患者有便秘等多种肠道问题，可以适当服用医用石蜡油，但是注意使用的量不要太多。另外，也需要注意使用的次数不要太频繁，避免出现依赖性的问题。
在医院里面，肛肠科医生在做肛门指检的时候需要涂抹一定量的石蜡油，避免过于干燥导致肛门裂开及患者舒适度不够等问题。检验科在做肛肠镜检查的时候也会使用一定量的医用石蜡油，也是用于润滑，达到润滑的效果。患者如果有轻微的肠梗阻，医生也可能会选择注入医用石蜡，可以得到缓解的效果，润滑患者的肠道。如果患者的胃肠需要做减压，在胃管放直的时候也需要使用该药物，胃管在涂抹石蜡之后会变得润滑，对黏膜的损伤就越小。