呼吸道感染包括上呼吸道感染和下呼吸道感染，广义的上呼吸道感染还包括细菌性鼻窦炎等鼻部的疾病，所以呼吸道感染的治疗不能一概而论：
1、急性上呼吸道感染的治疗，急性上呼吸道感染的主要病原体是病毒，少数是细菌。对于急性上呼吸道感染的治疗主要是对症治疗，对有急性咳嗽、鼻后滴漏和咽干的病人，可以给予伪麻黄碱治疗，以减轻鼻部充血，亦可局部滴鼻应用，必要时加用解热镇痛类药物，小儿感冒忌用阿司匹林。另外在有细菌感染的征象时，可应用抗生素治疗，细菌感染的征象包括白细胞升高、咽部脓胎、咳黄痰、流鼻涕等细菌感染的证据。普通感冒是无需使用抗生素的，流鼻涕指的是流黄涕，普通感染是无需使用抗生素的。抗病毒治疗，目前对于急性上呼吸道感染基本不需要抗病毒治疗，只要对症治疗就可以，因为疾病是有自限性的，对于免疫缺陷的病人，可早期常规应用抗病毒治疗，奥司他韦和利巴韦林都有广谱的抗病毒作用，对流感病毒、副流感病毒和呼吸道合胞病毒等，有较强的抑制作用，可缩短病程，也可以运用一些中医中药的治疗。
2、除了上呼吸道感染，还有下呼吸道感染，下呼吸道感染包括支气管炎和肺炎，由于引起下呼吸道感染的病原体不同，治疗应用的药物也有所不同，引起下呼吸道感染的病原体包括细菌、病毒以及非典型病原体，医生会根据引起下呼吸道感染的不同病原体，进行针对性药物治疗。