如果母亲是小三阳，虽然病毒复制不活跃，传染性也不强，但为了保险起见，新生儿也应该注射抗乙肝免疫球蛋白和乙肝疫苗，进行母婴阻断治疗。母亲小三阳，也不能完全表示没有乙型肝炎病毒载量，也有极个别患者发生病毒变异时，虽然是乙肝小三阳，但病毒载量也较高。
所以，母亲只要是乙肝病毒携带者，新生儿出生之后就应该进行母婴阻断，最好在24小时之内注射乙肝免疫球蛋白和乙肝疫苗，而且越早越好，若能在出生两小时之内注射就更好。注射乙肝疫苗和高效价免疫球蛋白，是目前进行母婴阻断最有效的办法，成功率可以达到95%左右。