浅表器官的常规超声检查不痛，检查时患者平卧位、坐位、站位，根据检查部位不同，选择不同的适宜体位。先将所要检查部位涂抹耦合剂，探头在其相应的体表位置处温柔移动，都不需要用力，患者多无不适感。
超声检查基本上都是无创检查、无痛苦、不损伤身体、无辐射、安全性高的一种检查方法，对于经阴道妇科超声和经直肠的前列腺超声检查稍有不适感，基本上都可以耐受，无不良后果。对于经食道的心脏超声检查，属于半创伤性检查，需要在口腔喷洒麻药，类似做胃镜感觉，大部分患者都能接受。