甲型流感病毒阴性，通常说明患者本身疾病不是由甲型流感病毒所引起，但病情是否严重，还需要结合患者临床表现，以及患者自身免疫状态等决定。如果患者病情表现比较轻，发热伴有轻微感染中毒症状，一般病情不严重。
但如果患者一般情况比较弱，本身有严重基础疾病，这种情况即使不是甲型流感，若是乙型流感或者其他流感病毒引起流感，病情可能也会逐渐加重。尤其是老年人、免疫功能低下人群，其他流感病毒也可以引起流感肺炎。另外，如果不是流感病毒感染，患者有发烧，全身感染中毒症状非常严重，比如有高热、头疼、食欲减退、乏力、精神状态萎靡等，也要警惕患者病情加重，应该及时到医院就诊。