新型冠状病毒肺炎核酸检测阴性，意味着未感染新型冠状病毒。新型冠状病毒核酸检测采取PCR扩张的技术，灵敏度高，主要对咽拭子、鼻咽拭子、痰、下呼吸道分泌物、血液、粪便、尿液等标本，进行新型冠状病毒检测，其中痰和下呼吸道抽取物检测的准确率更高。
核酸检测因为受到病程、标本采集、检测过程，以及检测试剂的影响，可能会出现假阴性，所以对于高度可疑的疑似病例存在核酸检测阴性时，也不能完全排除新型冠状病毒的感染，可以通过再次复查核酸检测，或者通过血清学检测结果，进行综合判断分析。