先天性无虹膜的主要病因是神经外胚层和中胚层在胚胎发育过程中出现发育障碍，无法直接预防。早期发现、早期诊断、早期治疗对预防本病具有重要意义。孕期应做到定期检查，若孩子有发育异常倾向，明确后应及时行人工流产，以避免疾病患儿出生。提高产前诊断技术，预防遗传患儿的出生，提高优生率。
（1）提高产前诊断技术，预防遗传患儿的出生，提高优生率。
（2）适龄结婚，切勿早婚、早孕，也勿过于晚婚、晚孕，避免婴儿先天不足，有计划地优生优育。
（3）孕妇应注意陶冶性情，保持心情愉快，精神安宁。谨避寒暑，预防疾病，慎用药物，禁用烟酒，避免中毒、外伤及物理因素的影响。