自主神经功能衰退会导致出现植物神经功能紊乱，也可以影响到正常的消化功能，导致消化不良，具体处理如下：
首先，可以通过口服一些调节神经功能的药物治疗，比如谷维素、安神补脑液，也可以口服黛力新。另外，可以服用营养神经的药物，比如甲钴胺和维生素B1。
其次，要进行生活习惯的调整，因为长时间的精神紧张、焦虑、劳累，都可以影响到神经功能。平时需要放松心情，规律的生活，避免熬夜，保证充足的睡眠，同时加强户外锻炼，增强身体的体质。要注意饮食，可以多吃一些枸杞、桂圆、核桃、山药等。
然后，可以根据出现的症状用药，如果影响到消化功能，可以口服改善消化功能的药物，比如健胃消食片等。