咳嗽、发烧有可能是病毒也有可能是细菌，无论是病毒还是细菌，均可以导致咳嗽、发烧的症状。所以当患者出现上述临床表现时，建议完善血常规、C反应蛋白、病毒抗体、支原体抗体、胸片等相关的检查。
病毒感染者，白细胞一般正常或低于正常，淋巴细胞可以升高也可以低于正常，单核细胞一般会出现增加，C反应蛋白、降钙素原一般是正常的。
如果患者确诊为病毒感染后，可使用清热、解毒或者是抗病毒的药物，例如蒲地蓝、奥司他韦等。
细菌性感染，一般会出现白细胞、中性粒细胞、中性粒细胞百分比高为正常，C反应蛋白、降钙素原也会明显高于正常，确诊为细菌性感染后需要使用抗生素进行治疗。