肺结核的疗程比较长，药物治疗是结核病治疗的基石，相比其他类型的细菌感染，肺结核治疗可能需要更长时间。对于活动性肺结核，需服用抗结核药物至少6-9个月，具体药物和治疗时间取决于患者年龄、整体健康状况和耐药情况等。
化学治疗是肺结核最主要的基础治疗手段，其目标不仅是杀菌和防止耐药性的产生，还包括最终灭菌，防止和杜绝复发。肺结核化学治疗原则是为早期、规律、全程、适量、联合，常用的药物包括异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等，治疗过程中应实施全程督导化学治疗管理策略。