腭裂手术的最佳时间，通常在孩子12个月左右，尽量不影响孩子学语言。
有人主张要早，可以提前在8-9个月时行腭裂手术，但8-9个月的时候，孩子比较小，耐受全麻手术和腭裂手术的能力比较差。另外，大多数孩子都在8-9个月的时候还不能正常学说话、发音，过早的手术并不能改善病人的发音，一般孩子都是在12个月以后，才开始说单词。而12个月左右的孩子也明显比8-9个月的大，能够很好地耐受全麻手术和腭裂手术，术后反应相对较轻，恢复也比小一点的孩子要快一些。如果有腭裂的孩子，建议最好在12月左右进行手术。
腭裂手术可以选择气管插管全身麻醉，注意术前详细告知有无先天病史，有无服药史。做好辅助检查，例如胸片、彩超等，是否有手术禁忌。同时术前禁饮食，做好灌肠，做好充分的胃肠道准备。