乙酰半胱氨酸是一种黏液溶解剂，临床需要根据患者的情况，即是否有副作用及疾病的类型，进而决定应用的疗程。
乙酰半胱氨酸能破坏多肽中的双硫键，使黏液稀薄，容易咳出。所以临床主要用于化痰，常用的疾病为慢性支气管炎、肺炎及肺间质纤维化等。而且其应用的疗程需要根据患者疾病的情况，还有是否出现副作用来判定。作为化痰药，如果患者应用乙酰半胱氨酸之后，症状明显好转，可以停药，无具体的疗程。乙酰半胱氨酸还可以用于抗纤维化，即用于肺间质纤维化治疗，则可以长期应用。但需要注意药物的副作用，如患者是否有胃肠道反应。如果胃肠道反应很重，需要停药，还要注意药物的禁忌症。对本品过敏时，如支气管哮喘患者、严重的呼吸道阻塞者或者严重的呼吸功能不全的老年人应禁止应用。
患者使用乙酰半胱氨酸泡腾片时需要注意，要将药片溶于温水中加以搅拌，待完全溶解或气泡完全消失后再服用。而且切记不能将乙酰半胱氨酸泡腾片整个吞服，否则容易引发窒息，出现意外。