息肉病切除的方法临床有很多，切除的主要方式也要根据的息肉的部位，或者是病情的程度所决定。对于鼻腔或者是咽部的息肉，可以通过微创介入的方法，鼻内窥镜，或者是局部麻醉镜下进行息肉的切除。
对于胃肠道的息肉，如果是单纯的基底部比较宽或者是息肉的病变比较单一。这种情况可以通过内科肠镜、胃镜介入下，将息肉进行切除或者是局部圈套法，能够完整地将息肉切除。切除后还要对息肉进行病理学的检测，如果良性，术后定期复查就可以。
对于某些切除的息肉发现恶性程度较高，还要进行根治性的手术，如胃肠，需要进行胃肠道肿瘤的根治性癌症手术。