智齿冠周炎要想彻底治疗，就是在急性期和慢性期都需要进行正规的治疗。急性期需要全身口服抗生素，推荐口服头孢类的抗生素加上甲硝唑类的药物，局部再配合冠周盲袋的冲洗，也就是用双氧水、盐水反复冲洗智齿冠周的盲袋，将盲袋当中的食物残渣、软垢、细菌、脓汁都冲洗出来，在盲袋内再外用碘甘油，就可以控制炎症。另外，要配合好好刷牙，来保持口腔卫生，防止口腔内细菌大量繁殖，加重感染。
在急性期控制以后，就进入了慢性期，慢性期必须要针对病因进行治疗。如果智齿位置和方向不正确，或者是没有对颌牙，或者是上下颌智齿的咬合方向不好，没有形成良好的咬合关系，就需要尽早在局麻下将智齿拔除，预防智齿冠周炎的复发。如果位置方向正确，可以进行冠周龈瓣的切除，也可以预防复发。