HIV窗口期虽然测不到艾滋病病毒的抗体，但体内已经有艾滋病病毒复制，可以通过HIV核酸检测查到HIV-RNA病毒，因此处于窗口期的感染者，同样具有传染性。
普遍应用的HIV特异性抗体检测是第三代检测试剂，其窗口期是六周。应用第四代检测试剂，在窗口期内也可以进行HIV抗体和P24抗原联合检测，可以在感染HIV病毒之后的第二周检测到，可以更早地对高危人群进行排除，HIV核酸检测可以在感染HIV病毒之后的第一周，就可以查到HIV-RNA病毒。
如果感染了HIV病毒，在感染之后的第六周应用第三代检测试剂进行检测，HIV抗体的检出率是99.9%，所以如果应用第三代检测试剂，在高危之后第六周检测的结果是阴性，基本上就可以排除HIV病毒感染；应用第四代检测试剂进行检测时，在第二周之后如果是阴性的结果，基本上也可以排除HIV病毒感染，如果不放心，也可以在高危之后的第三个月，或者第六个月再复查一次，如果结果是阴性，就可以排除HIV病毒感染。