早晨起来吐痰是咖啡色的原因如下：
1、可以见于长期吸烟的人，或者有呼吸系统感染性疾病的患者、咯血的患者，如果出现了咖啡色的痰，一定要去医院就诊，通过肺部CT等进一步检查明确是否有病变。如果是呼吸系统感染性疾病，常见于吸烟的患者并发细菌感染，可以给予抗生素抗感染治疗，常用的有青霉素类的阿莫西林、阿莫西林克拉维酸，大环内酯类的阿奇霉素、红霉素，头孢类的头孢羟氨苄、头孢呋辛、头孢地尼等，如果是18岁以上的成人，也可以给予喹诺酮类抗生素进行抗感染治疗，常用的药物莫西沙星、甲磺酸左氧氟沙星等，咯血的患者可以见到咖啡色样痰，由于血液较长时间的存在于气道或者肺部，所以咳出后不是鲜红色，而呈现咖啡色。
2、也可以见于鼻部出血到流入咽部，或者咽部本身的出血。
3、还可以见于肺部本身的病，比如肺结核、支气管扩张、肺栓塞、肺部恶性肿瘤等，治疗除了对症止血治疗以外，肺结核要进行规律的抗结核治疗，支气管扩张咯血一般由于感染或者毛细血管破裂而引起，予以抗生素抗感染治疗，肺栓塞可以给予抗凝治疗，必要的时候溶栓以及手术取栓治疗，肺部恶性肿瘤要根据不同的病情给予手术切除、放化疗或靶向治疗等。
如果出现了咖啡色样的痰，一定要去医院进一步检查明确原因，及时治疗。
