霉菌性阴道炎应该进行抗真菌的治疗，包括局部和全身的治疗。在治疗的同时应该避免再次的霉菌感染，有必要的性伴侣也应该进行霉菌的检查，而且要找出可能引起霉菌的原因，避免再次感染。
患者要考虑自身有没有肠道及口腔的霉菌感染，霉菌治疗后要及时复查，如果患者反复出现霉菌性阴道炎，要在治疗的同时注意提高阴道局部的抵抗力、免疫力，可以使用乳干菌增加阴道的局部的抵抗力、免疫力，避免再次感染。