扁桃体出现化脓的情况下，如果脓性分泌物覆盖过多，可以适当对扁桃体表面附着的脓性分泌物进行清理，但是不建议使用棉签强行刮除，可以到医院进行进一步清理。医生可以使用吸引器进行适当的清理，避免损伤扁桃体实质。
同时，在治疗上，最根本的是需要针对扁桃体炎症感染的情况，积极的使用抗生素进行抗感染治疗。对于扁桃体化脓的患者，多数情况下都需要采取静脉输液抗感染的治疗措施，常常选用青霉素类、头孢菌素类的抗生素，能够起到较好的治疗改善效果。咽喉局部可以使用一些含片类以及喷剂类药物，来治疗和改善。