冠状动脉造影是微创的手术，在临床上是比较成熟的一个有创的诊断技术。一般来说出现的并发症的机率较少。可能出现的并发症有：
1、穿刺部位出血。冠状动脉造影通常选择桡动脉、股动脉穿刺，由于穿刺的部位是动脉因此出血较常见。
2、造影剂过敏。患者术中或术后会出现过敏反应，如皮疹、瘙痒，需给予抗过敏治疗。
3、假性动脉瘤。如果出现假性动脉瘤需局部的压迫等治疗。
4、冠状动脉穿孔及心包填塞，这是严重的并发症。出现的机率很小，一旦出现需紧急的抢救立即行心包穿刺术。