腘窝囊肿发生在膝关节的后方，经常是在无意中发现膝关节后方的饱满，用手摸可以摸到鸡蛋样大，甚至是更大的包块，比较硬，表面比较光滑，核磁上可以看到在膝关节后方出现囊性的积液，称为腘窝囊肿，这种囊肿与膝关节的关节腔是相通的，常在膝关节后方关节囊有薄弱区，形成单向的阀门，关节液只从膝关节腔向腘窝囊肿内流动，而不会反流，所以囊肿会逐渐增大，有时会压迫囊肿周围的血管，引起下肢的酸胀不适。
囊肿的治疗包括对于膝关节本身关节炎的治疗，如口服抗炎镇痛药物、口服营养关节的药物以及氨基葡萄糖，也可以关节腔封闭进行治疗，比较大的骨囊肿，应该进行手术切除。手术有两种方法，一种是在膝关节后方切开，将囊肿完全切除，缺点是伤口比较大，而且有发生感染和切口皮肤坏死的风险。另一种方法是通过关节镜手术技术在关节腔内将囊肿切开，形成关节腔和囊肿腔的完全畅通，囊肿自然就会吸收。