口服避孕药发生了意外怀孕，可能和服用方法错误，以及避孕药的避孕效果有关。对于避孕药所采用的避孕方法，主要是根据避孕药里面所含的成分抑制排卵，并且对于生殖器官也有直接的作用，常见情况如下：
一、抑制排卵：
下丘脑-垂体-卵巢轴的功能异常，而达到抑制排卵的作用。避孕药可以抑制下丘脑释放GnRH，使垂体分泌FSH和LH减少，同时直接影响垂体对于GnRH的反应，不出现排卵前的LH高峰，所以不会发生排卵。
二、直接作用生殖器官：
1、作用于子宫及宫颈：主要是改变宫颈管黏液的状态，避孕药可以使宫颈管黏液变少，变得高度黏稠，拉丝度减少，不利于精子的通过，同时也可以改变子宫内膜的性状。胚胎着床的关键是胚胎的发育和子宫内膜变化必须同步，而避孕药中的孕激素可以干扰雌激素效应，以抑制内膜增殖，使腺体变得小，而且使螺旋动脉发育不良，间质细胞发生蜕膜样变，这样的内膜就不利于受精卵的着床。
2、作用于输卵管：改变输卵管的功能，在避孕药的作用下，输卵管正常的分泌和蠕动的功能发生改变，也可以干扰受精卵在输卵管中的运行速度，从而干扰受精卵的着床。
根据避孕药的作用机制，使用避孕药期间，发生意外怀孕的几率比较小，但如果服用的时间错误或者服用的方法错误，同样也会发生意外怀孕，一般妊娠率为1/100。
