甲状腺过氧化物酶抗体过高，是机体产生了自身免疫性疾病，机体把甲状腺当成抗原产生了自身抗体，包括出现了甲状腺过氧化物酶抗体增高、微粒体抗体升高，以及促甲状腺激素受体抗体升高。
多见于桥本甲状腺炎、弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症，以及一些自身免疫性疾病，包括类风湿性关节炎、皮肌炎、多发性肌炎、系统性红斑狼疮。发生这些自身免疫性疾病时有可能出现抗体的升高，单纯出现抗体升高时还要注意患者的临床症状和体征。如果甲状腺激素水平没有变化，或者发生了甲状腺激素合成分泌减少导致的甲状腺功能减退症时，要给予对症的治疗。如果没有甲状腺疾病，需要注意是否发生了其它自身免疫性的疾病。