低烧三天应该说与是不是脑炎之间没有直接的联系，因为我们知道任何原因引发孩子体温中枢出现紊乱，都可能出现发热的现象。如果发热引起的病因不去除，都可能会持续出现发热，不论是发热三天还是发热几天，它都是感染没有控制或者病原没有去除的表现。
如果是脑炎的话，不一定非要低热三天，有可能在发热第一天就可以是脑炎的问题，因为脑炎并不是因为持续发热造成的，而是因为外界的病毒或者细菌侵入血-脑屏障进入脑内，引起脑部发炎造成的，所以孩子在脑炎的时候不仅有发热的症状，可能还会有意识不清、头痛、恶心、呕吐或者是伴有抽搐，有一些会有意识障碍，这些都是早期孩子脑炎的一些临床表现。如果孩子低热三天，没有这些临床症状或者没有临床体征，一般也不再考虑脑炎的情况，但是如果这种低热存在这些情况，可以适当的进行相关检查之后明确诊断。如果出现低热三天，一定要明确孩子的病因，然后才能对症治疗，但肯定不是所有的低热三天都是脑炎造成的。