晨起咳黄脓痰考虑合并有感染的问题，常见的病因包括支气管炎、肺炎、支气管扩张合并感染以及鼻窦炎等可出现上述的临床症状，具体的诊断应该结合患者的相关检查进行全面的评估。应该完善鼻窦CT、肺部CT检查，同时进行相应的实验室检查。另外，针对黄脓痰进行细菌培养，明确引起感染的疾病并给予针对性的治疗。如果明确感染以后，在抗感染时应该进行足疗程的抗感染治疗，从而更好的控制临床的症状，利于患者的恢复。