如果是小的房间隔缺损，直径不超过五毫米，也没有出现右心房和右心室增大，不需要积极进行治疗，只需要每年进行一次心脏超声的评估来观察右心负荷即可，这类患者可能终身都不需要进行手术干预。
如果是超过五毫米以上的房间隔缺损，考虑对房间隔缺损进行闭合治疗。闭合房间隔缺损有两种方式，第一种方式是外科手术治疗，第二种方式是通过微创介入封堵的方式进行房间隔缺损封堵术。
手术开刀的方法是传统方法，可以进行房间隔缺损的修补。微创介入的方法是通过不开刀的形式，通过血管送入封堵器，将封堵器有效的闭合房间隔缺损，目前是根治房间隔缺损的主流治疗方法。