结石不会引起痛经，痛经是女性在月经期因经血不畅而引起的生理性疼痛，有其规律性，与月经周期直接相关，与结石并没有任何关系。
泌尿系结石也可引起疼痛，特别是输尿管下段的结石，结石刺激输尿管痉挛、缺血而引起疼痛，疼痛可放射至下腹部、会阴区，类似于痛经引起疼痛的范围。
如果输尿管结石发病时恰逢女性月经期，有可能会被误认为痛经而引起，因此延误病情。输尿管结石不仅引起下腹部、会阴部疼痛，还会有典型的肾绞痛表现，可以明确鉴别。