目前对于良性病因引起的胆管炎经过早期积极治疗后可恢复正常，部分患者可出现复发，发生占位性病变患者，要积极治疗原发病。临床对于慢性胆管炎的治疗，主要是控制感染、解除梗阻、通畅引流的治疗原则，具体包括手术治疗和药物治疗两种方法，治疗过程需要根据不同病因和疾病程度来选择采取不同的治疗措施。
一、药物治疗
1、抗生素：可选用三代头孢类药物及抗厌氧菌药，如头孢地尼、替硝唑。
2、抑酸治疗：主要使用PPI制剂，如雷贝拉唑。
3、对症治疗：根据具体情况，选择相应药物，如熊去氧胆酸等。
4、免疫抑制药物：可以利用皮质激素治疗原发性硬化性胆管炎。
二、手术治疗
慢性胆管炎是由于急性胆管炎经非手术治疗后，病情未得到控制、反复发作所致，应积极寻找病因，采用手术治疗，去除胆管梗阻因素，保证胆道引流畅通。
1、针对胆结石、胆总管结石引起的胆管炎，若身体条件允许，均应行胆囊切除术加胆总管切开取石术，该手术可解决胆道梗阻，该治疗需带引流管6~8周。
2、对于不能行手术治疗的患者，也应早期行胆胰管造影取石术或支架置入术，通畅引流，缺点是并发急性胰腺炎的风险增高，若十二指肠乳头切开，则还可能引起十二指肠乳头功能障碍。
3、对于占位性病变引起的胆管炎，应早期行肿瘤根治术。若不能耐受手术，可行胆囊穿刺或经皮肝穿刺胆道引流术进行早期引流。
4、对于有持续性黄疸合并胆汁性肝硬化、属于弥散型原发性硬化性胆管炎的患者，可考虑采用肝移植的方法治愈疾病。
三、营养治疗
静脉给予水、电解质、维生素、蛋白质等以补充营养、提供组织修复原料。