小儿肠系膜淋巴结发炎的病因有以下几点：
1、体质因素，有些体质、免疫力近期变差的孩子容易诱发肠系膜淋巴结的肿大，或者全身多处的淋巴结肿大，以及肠系膜淋巴结的炎症。
2、其他系统或者多系统的病毒、细菌感染易导致肠系膜淋巴结反应，比如说上呼吸道感染、泌尿系的感染、血液系统的感染等等均会诱发肠系膜淋巴结发炎。
3、腹腔炎症性的因素，比如阑尾炎、肠套叠等等腹腔的炎症导致了肠系膜淋巴结的肿大、发炎。
4、其他一些病变，比如说一些恶性的淋巴瘤或者是肠功能的改变，都会引起肠系膜淋巴结的一些病变，这些都是小儿肠系膜淋巴结发炎的原因。