药流后子宫内膜不均质，一般与少许蜕膜残留相关。药流与人流不同，仅仅排除孕囊，孕囊周围的蜕膜组织需要自行排出和吸收。
药流后阴道出血时间长，出血较多，而且常常有宫腔残留。如果有较多残留，需要手术清宫，占药流的10%左右。
如果有极少量的残留，表现为内膜回声不均质，常常给予益母草等宫缩剂对症治疗，一般来过月经之后会消退。有个别女性会表现为月经淋漓不尽，之后复查B超发现宫腔有较多残留，需要手术清宫。