慢性扁桃体炎的治疗可分为手术治疗和保守治疗两个方面。慢性扁桃体炎是感染免疫性疾病，如果急性扁桃体炎反复发作，每年超过五次以上，扁桃体已经成为病灶，对身体造成损害，这时建议手术切除。
如果扁桃体炎发作的次数比较少，每年有2-3次，可以建议药物控制或者免疫疗法增强抵抗力，避免扁桃体炎的发生。
所以对于扁桃体炎的治疗，如果发作比较频繁，每年超过五次以上或者扁桃体肥大比较严重，超过Ⅲ度以上，影响呼吸、影响睡眠质量，建议手术切除。
如果扁桃体发作次数比较少，每年在五次以下，并且扁桃体本身不是特别大，不影响吞咽、睡眠，可以暂时保守治疗。